m6A甲基化基因对皮肤黑色素瘤发病影响的分析

摘要

目的 通过对皮肤黑色素瘤以及正常皮肤的m6A相关基因的表达和预后进行分析,探索皮肤黑色素瘤的发病机制.方法 从UCSC Xena上下载TCGA黑色素瘤病人和GTEx正常人皮肤组织的RNA表达数据,对文献报道的23个m6 A相关基因进行差异表达分析;对表达有差异的基因使用R语言survival包进行生存分析,并得到与预后关系最密切的基因;采用GESA分析方法 预测预后相关基因富集的基因集.结果 表达分析找到的差异基因共有21个,其中与预后关系最密切的基因只有3个,分别是IGF2BP1、METTL3和YTHDC2.在GSEA分析中,IGF2BP1、METTL3和YTHDC2主要富集在心脏肌肉收缩、核苷酸切除修复、RNA降解、泛素介导的蛋白质水解、基础转录因子、MTOR信号通路、非小细胞肺癌和胰腺癌等基因集.结论 m6A相关的基因中,IGF2BP1、METTL3和YTHDC2可能通过多种途径影响皮肤黑色素瘤的发生,未来可能可以作为该疾病的预后标志或潜在治疗靶点.