利用肿瘤基因组图谱数据库结合免疫相关基因分析睾丸生殖细胞肿瘤预后

摘要

目的 探讨睾丸生殖细胞肿瘤的预后影响因素,并通过挖掘癌症基因组图谱(TCGA)数据库结合免疫相关基因进行分析.方法 从TCGA数据库下载156例睾丸生殖细胞肿瘤的一般临床资料及mRNA、lncRNA数据,通过R语言程序包筛选差异基因,使用Cox回归模型分析睾丸生殖细胞肿瘤数据,结合免疫相关基因,评价睾丸生殖细胞肿瘤的预后相关因素.结果 在免疫相关差异表达基因中,依据Cox回归分析模型,筛选出免疫相关mRNA 47个,相关lncRNA 8个,使用lasso回归模型筛选相关mRNA与lncRNA,AP002954.1、AC090559.1、CCL8、TLR7、CYSLTR1、HTR3B,与睾丸生殖细胞肿瘤患者的生存密切相关.结论 通过分析TCGA数据库睾丸生殖细胞肿瘤的信息,筛选了免疫相关基因,并构建了生存相关模型.