鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡转录组学分析

摘要

目的 为了分析鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡后宿主基因表达水平的变化.方法 以鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡,收集肺脏进行高通量测序.结果 与对照组相比,感染组得到差异表达基因740个,其中上调基因有602个,下调基因有138个.G()条目分析发现,差异基因主要涉及免疫应答反应和炎症反应等.经KEGG数据库比对注释及富集分析显示有7个通路富集显著,其中Toll-like信号通路有11个基因表达上调,分别为IL-6、TLR4、PIK3、IRF7、MD-2、IRF5、MYD88、CD86、STAT1、TLR2和CCL4,NOD-like受体信号通路有7个基因表达上调,分别为IRF7、CTSB、P2RX7、CYBB、PSTPIP1、HSP90AA1和NAMPT.结论 鸭源H7N9亚型病毒感染SPF鸡后,免疫相关基因表达明显增强.在Toll-like信号通路中,TLR4在MD-2的协助下被激活,随后依赖MYD88途径激活下游的IRF5,继而引起CCL4、IL-6显著表达.同时NLRP3炎症体在H7N9亚型病毒感染过程中也发挥着重要作用.