IBV D41株主要结构基因及3′端非编码区序列分析

摘要

采用反转录及聚合酶链式反应(RT-PCR),成功地扩增出鸡传染性支气管炎病毒(IBV)人工致弱毒D41株S1基因、M基因、N基因和基因组3′端非编码区(UTR)的cDNA.序列测定结果表明:D41株的S1基因全长1611 bp(从ATG到S前体蛋白裂解位点),编码一条由537个氨基酸组成的多肽;M基因全长678 bp,编码一条由226个氨基酸组成的多肽;N基因全长1230 bp,编码一条由410个氨基酸残基组成的多肽,3′端UTR长度为525 bp,其中高变区(HVR)长度为225 bp.与国内外已报道的一些IBV标准毒株的相应基因序列进行核苷酸序列同源性分析后发现:D41株与麻省血清型的毒株同源性最高,尤其与国际常用的标准疫苗株H52和H120的亲缘关系最接近.但它与国内"腺胃型"毒株QXIBV在系统发生进化树上却相隔较远.