猪瘟病毒E2基因的扩增及序列分析

摘要

本研究利用RT-PCR技术,对流行于国内部分地区的9株猪瘟病毒(CSFV)E2基因进行扩增,与C-株等4株参考毒株做了同源性比较,绘制了遗传进化关系发生树,结果表明,所测序列共由442个氨基酸残基组成.可将13株CSFV分为两个组群,其E2基因间的核苷酸序列同源性为81.9%～99.7%,所推导氨基酸序列同源性为88.2%～99.5%,其中9株CSFV E2基因的长度均为1 324 bp,编码的氨基酸序列均包括完整信号肽序列和跨膜区序列,9株流行毒株与C-株之间核苷酸序列同源性为81.9%～95.3%,所推导氨基酸序列同源性为88.2%～95.5%.说明近期流行毒株的变异呈现一定的多样性,并且多数毒株已向远离疫苗株方向变异.