橡胶树AtCAB1同源基因的克隆及其在稳定与衰老期叶片中的差异分析

摘要

以一编码蛋白与拟南芥的CAB1高度相似的EST序列作为探针,通过同源搜索从橡胶树的转录组数据中电子克隆到一条长1415 bp的cDNA,该序列包含-798 bp的ORF及47 bp的5’UTR和570 bp的3’UTR,命名为HbCAB1;在此基础上,采用PCR技术成功扩增了包括该ORF在内的915 bp的cDNA序列.序列分析表明,该基因预测编码265个氨基酸,理论分子量为28.15 ku,等电点为5.25;蛋白含有1个保守的捕光叶绿素a/b结合蛋白结构域,3个跨膜螺旋和1个C端螺旋,1个三聚化基序,以及多个叶绿素和类胡萝卜素结合位点;蛋白与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)、橄榄(Canarium album)中同源蛋白的相似性都在95％以上,显示出基因进化的保守性.半定量RT-PCR分析显示,与稳定期叶片相比,HbCAB1在衰老期叶片中的转录水平显著下调.