猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)CH-1a株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究

摘要

本研究对猪生殖－呼吸道综合征病毒（ＰＲＲＳＶ）的非结构基因，包括ＯＲＦ１基因、５’端非编码区基因（Ｎｏｎ－ＣｏｄｉｎｇＲｉｇｏｎ，ＮＣＲ）和３’端非编码区基因（ＮＣＲ）分别进行了分子克隆和测序，并对其基因特征作了研究分析。结果表明，ＰＲＲＳＶ－ＣＨ－１ａ株ＯＲＦ１ａ起始密码子上游是由保守序列５’ＵＵＡＡＣＣ３’连接的５’ＮＣＲ，在该区附近的约４３个碱基有较高的保守性，其余核苷酸的变异较大。ＯＲＦ１ａ编码的多聚蛋白又可切割生成六个非结构蛋白（Ｎｓｐ１ａ、Ｎｓｐ１β、Ｎｓｐ２－５），其中Ｎｓｐ２可能具有型特异性，在不同基因型的ＰＲＲＳＶ分离株之间表现出较大的变异，和ＶＲ２３３２株的ＮｓＰ２的编码基因相比有８６％的同源性，同ＬＶ株只有４５％的同源性；ＯＲＦ１ｂ所编码的聚合蛋白经切割后形成四个非结构蛋白（ＲｄＲｐ、ＣＰ２－４），同 ＯＲＦ１ａ所编码的蛋白相比较为保守，但是，在ＣＰ４的Ｃ端仍有较大的变异，其编码区和ＶＲ２３３２株相比有８８．７％的同源性，而和ＬＶ株只有５３．４％的同源性。ＣＨ－１ａ株的ＯＲＦ１ａ－ＯＲＦ１ｂ的衔接区为核糖体移码区，在所有的ＰＲＲＳＶ分离株中高度保守，具有保守的５’ＵＵＵＡＡＡＣ３’序列和