鹅副粘病毒YG97分离株HN蛋白基因的克隆与序列分析

摘要

鹅副粘病毒分离株YG97经10日龄鸡胚增殖后纯化,提取病毒的基因组RNA,采用RT-PCR一次性扩增出与预期设计的1.9kb大小相符合的特异性条带.将扩增产物提纯后克隆入pGEMR-T载体,经转化、筛选及酶切鉴定后,初步获得了含鹅副粘病毒HN基因的阳性克隆,进一步进行了序列测定.序列分析表明所扩增的病毒的HN基因片段的长度为1981bp,共编码571个氨基酸.同源性分析表明,YG97与LaSota毒株核苷酸同源性为79%,氨基酸的同源性为87%.与台湾1995年分离株Taiwan/95核苷酸和氨基酸的同源性分别为93%、96%,说明YG97与Taiwan/95亲缘关系较近,具有较高的相似性.与国内外部分发表的其它NDV毒株的核苷酸同源性在80%～84%之间,氨基酸的同源性在87%～91%之间.同源性分析表明YG97相对于经典的NDV在HN基因上发生了较大的变异.