2016—2018年济南市生活污水轮状病毒A组分子流行病学特征分析

摘要

目的了解生活污水中的A组轮状病毒（RVA）的检出情况及分子流行病学特征。方法本研究于2016—2018年3年期间,在济南市每月采集生活污水,获得的36份污水样本通过阴离子膜吸附洗脱法浓缩后,进行核酸提取,RT-PCR扩增RVA VP7和VP4基因片段,再经纯化、TA克隆和测序后,对所获得的序列进行基因定型、同源性分析和系统发生学分析。结果 36份污水样本中有31份检测出RVA G基因（检出率为86.1%）,33份样本检测出RVA P基因型（检出率为91.7%）。共获得RVA序列536条,其中G基因型序列225条,分属于6个基因型,G9型别占比最多为92.4%（208条）;获得P基因型序列311条,分属于4个基因型,优势型P[8]占50.1%（156条）,P[4]次之为41.8%（130条）。系统发生学分析显示优势型别G9、P[8]在当地均存在多个传播链共循环。结论本研究通过对济南市生活污水所获得的RVA相关序列进行型别、同源性、系统发生学特征的分析,进一步证实RVA环境监测可行且必要。