SIP1单核苷酸多态性rs41292293和rs34961586与先天性巨结肠的关系

摘要

目的探讨SIP1基因单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs）rs41292293和rs34961586与先天性巨结肠病（Hirschsprung disease,HSCR）关系,为评估HSCR患病风险奠定基础。方法提取病例组（HSCR患儿）和对照组（正常健康人）各180例外周血基因组DNA,聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR）法扩增SIP1基因2个外显子（exon5-rs41292293和exon6-rs34961586）,PCR产物用限制性内切酶HhaⅠ和RsaⅠ消化与测序,以进一步确定基因突变位点,应用x~2检验统计分析病例组和对照组等位基因频率、基因型频率及其患病风险。结果 HSCR组与对照组SIP1 rs41292293 GA和GG基因型频率及A和G等位基因频率差异显著（P＜0.05）,AA基因型高于GG基因型,AG在HSCR组中存在多态性,对照组与HSCR SNPs基因型分布GA、AA和GG分别为48.89%、35.000%和16.11%与37.78%、49.44%和12.78%,比较发现A（68.33%）和G（31.67%）等位基因频率有显著性差异（P＜0.05）;HSCR组与对照组SIP1rs34961586 GC和GG基因型频率及C和G等位基因频率差异显著（P＜0.05）,GG基因型显著高于CC基因型,GC在HSCR组中存在多态性,对照组与HSCR SNPs基因型分布GC、GG和CC分别为34.44%、56.11%和9.45%与46.11%、39.44%和14.45%,比较发现G（65.83%）和C（34.17%）等位基因频率有显著性差异（P＜0.05）。测序rs41292293第268和256位密码子核苷酸CCC--CGA和TGG→TGT杂合突变;rs34961 586第135位密码子核苷酸CCA→CAC、TGC→TTC和TGC→TGG杂合突变。结论 SIP1 rs41292293和rs34961586与HSCR的发生有密切关系。为进一步研究该基因SNPs与其生理功能和疾病的关系提供基础资料。