DNA芯片检测乙型肝炎病毒基因多态性

摘要

目的建立DNA芯片检测乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)基因多态性的研究方法并对实验条件进行优化. 方法设计多条寡核苷酸探针,在硅烷化芯片的特定位置上,用点样仪将探针固定,并与PCR扩增的HBV基因相应区段杂交,杂交结果影印至硝酸纤维素膜,经BCIP/NBT避光显色,用放大镜观察杂交信号呈暗紫色圆点,根据特定位置上杂交信号的有无和与之相应的探针序列来判定基因突变的类型. 结果通过1次杂交反应可检测HBV前C/C区(nt 1896/1814)、BCP区(nt 1762/1764)和P区(nt 528/552)等多个位点的变异,与测序分析结果完全一致,具有较好的检测灵敏度和重复性. 结论 DNA芯片检测HBV基因常见突变位点多态性,操作简便易行,技术要求不高,具有临床推广应用价值,而且可以方便地通过向寡核苷酸探针阵列中添加相应探针,扩大基因芯片的检测应用范围,为临床检测提供了新的方法.