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IRF6基因rs2235371位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的相关性研究

         

摘要

目的 探讨干扰素调节因子6 (interferon regulatory factor 6,IRF6)基因rs2235371位点820G>A单核苷酸多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL士P)的相关性.方法 收集106例患者及其父母以及129名对照及其父母的核心家庭标本,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性的方法进行IRF6基因rs2235371位点单核苷酸多态性检测;用人群关联研究、传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT)、单倍型相对风险率(haplotype-based haplotype relative risk,HHRR)、家系为基础的关联检验(family-based association tests,FBAT)等方法进行统计分析.结果 病例组与对照组相比,子代的基因型分布差异无统计学意义(P>0.05),而等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05);母亲组基因型分布差异有统计学意义(P<0.05);按唇腭裂类型分类后,单纯唇裂组子代基因型分布和等位基因的频率与对照组相比差异均有统计学意义(P<0.05);而唇腭裂组基因型分布和等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05).传递不平衡检验提示,rs2235371位点的G等位基因在NSCL±P核心家庭中存在传递不平衡(x2=5.56,P=0.024).HHRR检验x2=5.115,P=0.024,OR=1.674,95%CI:1.069~2.621;FBAT检验Z=2.218,P=0.027.结论 在中国北方人群中IRF6基因rs2235371位点突变与非综合征性唇腭裂存在关联.

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