共生菌对小鼠肺泡巨噬细胞长链非编码RNA表达的调控作用

摘要

目的 探讨共生菌群对小鼠肺泡巨噬细胞长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)表达的调控作用. 方法 分离纯化共生菌缺失小鼠及正常小鼠肺泡巨噬细胞(alveolar macrophages,AMs),利用LncRNA芯片技术筛选差异表达的LncRNA并进行生物信息学分析,利用荧光原位杂交(FISH)、RNA干扰等技术检测LncRNA-30162的亚细胞定位及其对RAW264.7细胞基因表达的调控. 结果 分选后的AMs纯度大于95％,共生菌缺失小鼠与正常小鼠相比较,其差异表达LncRNA共有634个(变化倍数≥2),上调363个(57.26％)、下调271个(42.74％);差异LneRNA的靶基因与免疫系统调控、细胞分化、趋化作用等密切相关;干扰LncRNA-30162的表达可以降低RAW264.7细胞中CCL24及Arg1的表达水平,干扰前CCL24及Arg1的表达水平分别为(420.23±56.25)μg/L、(2.63±0.31)×103U/L,与干扰后表达水平(218.70±31.45)μg/L、(1.24±0.21)×103U/L比较差异有统计学意义(t=5.416、6.409,P=0.006、0.003). 结论 共生菌可以调控小鼠AMs LncRNA的表达,差异表达的LncRNA与多个基因功能分析分类和基因信号通路密切相关,LncRNA-30162可以调控RAW264.7细胞CCL24、Arg1的表达.