利用微阵列芯片技术筛选主动脉夹层致病相关基因

摘要

目的应用微阵列芯片技术观察主动脉夹层（Stanford B型）基因表达谱的变化,筛选差异表达基因,寻找致病相关基因。方法选取急性期的主动脉夹层（AD）标本6例,以6例正常胸主动脉作对照。抽提标本总RNA,纯化mRNA后逆转录,制备杂交探针,采用Phalanx人类全基因组芯片进行检测,应用DAVID、Pathwaystudio 5.0、SAM 3.01等软件对微阵列芯片的结果进行统计学、聚类和差异表达分析。选取两组间差异表达的7个基因,采用Real time PCR验证微阵列芯片结果。结果共得到6375个基因的有效数据,其中670个差异表达基因,AD组218个基因发生上调,452个基因发生下调;其中14个基因参与细胞间黏附;12个基因参与细胞外基质的生成;4个基因参与细胞与细胞外基质间黏附;14个基因参与细胞外骨架的组成;10个基因参与免疫与炎症反应;10个基因参与胶原合成;12个基因参与细胞凋亡。Real time PCR验证结果和微阵列芯片所得数据一致。结论 AD的发生伴随着多个基因的差异表达,微阵列芯片筛选差异表达基因,有助于找到与AD致病相关的基因;上述基因的差异表达可能是AD的重要发病机制。