遗传基因组学方法对Myoc基因调控网络的研究

摘要

背景原发性开角型青光跟（POAG）和高度近视的发病机制复杂，可能有较多致病基因及致病相关基因参与，构建基因调控网络有助于揭示发病机制。目的采用遗传基因组学方法研究Myoc基因的调控网络，探索其在POAG中的可能作用机制。方法Affymetrix基因芯片用于检测确定68个品系的BXD重组近交系（BXDRI）小鼠及其亲本C57BL／6J（B6）小鼠和DBA／2J（D2）小鼠、F1代小鼠眼组织中Myoc基因的差异表达。借助基因表达的数量性状分析（eQTL）方法，结合GeneNetwork网站（WWW．genenetwork．org）的在线分析工具，研究基因的作用特征，进而构建Myoc基因调控网络。结果Myoc基因在BXDRI小鼠眼组织中平均表达水平为10．83，不同品系小鼠表达量存在差异，其中B6小鼠表达量最高，达到11．43，BXD55小鼠表达量最低，为8．39。基因表达的eQTL分析结果显示，Myoc基因具有一个显著性QTL，其似然比统计量（LRS）达到21．78。该QTL位于2号染色体，与位于1号染色体的Myoc基因在不同的染色体，说明Myoc是反式调节基因。生物信息学分析方法进一步筛选结果提示，Olfml2a是Mroc的上游调控游候选基因。基于和Myoc高度相关基因的基因网络得以构建。结论本研究探索了Myoc的基因调控网络，显示遗传基因组学对复合性疾病发病机制的探索具有重要的指导作用。