中国宁夏地区年龄相关性黄斑变性患者的补体基因和ARMS2/HTRA1基因多态性分析

摘要

背景 年龄相关性黄斑变性（AMD）是导致全球老年人中心视力不可逆丧失的主要原因,且发病率逐年上升,但其发病机制一直是研究的热点. 目的 探讨补体因子H（CFH）、补体因子B（CFB）、年龄相关性黄斑变性易感基因2（ARMS2）/高温需求因子A1（HTRA1）基因多态性与宁夏地区人群AMD的相关性.方法 采用病例对照关联分析的方法,收集宁夏地区无亲缘关系的AMD患者150例为AMD组,民族、性别与之相匹配的拟行白内障手术者（排除其他眼部疾患）145例为对照组,采集所有受检者外周血5～10 ml,并提取DNA.选取CFH、CFB、ARMS2和HTRA1基因上的8个单核苷酸多态性（SNPs）位点,分别为位于CFH基因上的rs551397、rs800292、rs12124794、rs10737680、rs1410996,CFB基因上的rs641153,ARMS2基因上的rs10490924及HTRA1基因上的rs11200638,运用MassARRAY实验平台提供的MALDI-TOF分析软件对这些位点进行基因分型.采用χ2检验及非条件Logistic回归模型分析等位基因频率及基因型频率分布,并计算比值比（OR）值及95％可信区间（CI）,同时对多重比较进行Bonferroni检验校正,P＜0.006为差异有统计学意义.此外,运用Haploview软件分析各连锁不平衡区块以及基于连锁不平衡的单体型. 结果 所有SNPs位点基因型均符合Hardy-Weinberg平衡（HWE）.AMD组与对照组间共有7个SNPs位点基因型频率及等位基因频率上差异有统计学意义（P＜0.05）,但经过Bonferroni校正后,只有rs10737680、rs1410996、rs10490924、rs11200638基因型频率及等位基因频率在AMD组与对照组间差异均有统计学意义[P=0.003,P=0.003,P＜0.001,P＜0.001（均OR=1.000）];而rs800292（P=0.006,OR=1.643,95％CI：1.155 ～2.336）及rs641153（P=0.002,OR=0.273,95％ CI：0.120 ～0.620）2个位点仅在等位基因频率差异有统计学意义.此外,通过Haploview软件分析单体型发现,rs551397和rs800292位于同一个连锁不平衡区域,其单体型GC和AT经过50 000次的置换检验后,在AMD组和对照组间差异均有统计学意义（P=0.010、0.010）,而位于另一个连锁不平衡区域的rs12124794、rs10737680和rs1410996位点的单体型AAC、TCT、TCT频率在AMD组和对照组间的差异亦均有统计学意义（P=0.001、0.041、0.033）.rs641153位点等位基因T为AMD的保护因素（P=0.002,OR=0.273,95％CI：0.120 ～0.620）. 结论 CFH基因rs10737680及rs1410996位点、ARMS2基因rs10490924位点和HTRA1基因rs11200638位点的SNPs与宁夏地区人群AMD的发生存在相关性,是AMD发生的危险因素.