ARMS2/HTRA1基因与年龄相关性黄斑变性的关联分析

摘要

目的：探讨宁夏地区人群ARMS2/HTRA1基因的多态性与年龄相关性黄斑变性的相关关系。
　　方法：采用病例对照关联分析的方法，收集宁夏地区447例AMD患者作为病例组，以及906例拟行白内障手术者（排除其他眼部疾病）作为对照进行研究。抽取所有受试者外周静脉血6ml，并提取全基因DNA样本。基于HAPMAP数据库，选取ARMS2/HTRA1基因上的13个标签SNPs（rs10490923，rs10490924、rs2736911、rs2736912、rs2248799、rs2253755、rs2300435、rs55928386、rs10887154、rs11200647、rs2268356、rs2672585、rs2736914），对所有SNPs进行基因分型，分析各SNP与AMD之间的相关性。利用haploview4.02软件分析ARMS2/HTRA1基因的连锁不平衡区块，并分析区块内单体型与AMD之间的关联性。
　　结果：本研究分析的13个SNPs的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。关联研究结果显示：经校正年龄及多重检验校正P值后，rs10490924、rs2248799、rs2253755、rs2736911、rs2736912、rs2736914的等位基因频率分布与AMD遗传易感性有强关联性，P值均≤0.005，其中以rs10490924与AMD关联效应最强（OR=2.599；95％CI=2.180-3.099）。在加性模型及显性模型下，该6个SNPs的基因型分布亦与AMD遗传易感性相关联，通过校正后P＜0.05。此外，13个SNPs共可构建成3个连锁不平衡区块，其中Block1（rs10490924-rs2736912）区块内3种单体型TC、GC、GT与AMD显著关联（P＜0.000）。Block2（rs11200647-rs2753755-rs230043）内的AGG与AAG型在病例组与对照组间有统计学差异，但经100000次置换检验后，仅AGG型在两组间有统计学差异（P＜0.000）。
　　结论：ARMS2/HTRA1基因的rs100490924、rs2248799、rs2253755、rs2736911、rs2736912、rs2736914位点的多态性与宁夏地区人群AMD的发生存在相关性。rs10490924及rs2736912位点构成的3种单体型TC、GC、GT与AMD显著关联。

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前言

材料与方法

1.实验材料

2.研究对象

3.研究方法

结果

1. 研究对象的基本人口学特征

2. SNP检测结果

3. 单个SNP位点与AMD遗传易感性的关联分析

4. 基于单体型的关联分析

讨论

结论

参考文献

综述

致谢

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