北京地区TT病毒分离株全基因的克隆及序列测定

摘要

目的 克隆和测定北京地区TT病毒 （TTV）分离株全基因序列。方法 采用聚合酶链反应 （PCR）技术从 1例临床非甲～庚型肝炎病人血清中分段扩增TTV全基因 ,获得 5个互相重叠的片段 ,分别长 199bp（1 199） ,12 6 7bp（90 135 6 ） ,878bp（135 4 2 2 31） ,112 9bp（2 178 330 6 ） ,434bp（330 6 3739） ,用标准的分子生物学方法测定了这 5个序列 ,从而得到全长TTV基因序列。结果 北京地区TTV分离株全基因长 3739个核苷酸 ,含 2个开放读码框架 （ORF）。第 1个ORF位于 5 89至 2 90 2位核苷酸 ,编码 770个氨基酸 ,第 2个ORF位于 10 7至 715位核苷酸 ,编码 2 0 2个氨基酸。TTV基因的 5′和 3′末端为非编码区 ,分别有 10 6和 837个核苷酸。在该基因中A占 31 2 % ,C占2 5 4% ,G占 2 2 5 % ,T占 2 0 9%。北京地区TTV分离株与日本分离株的核苷酸和氨基酸同源性均在 95 %以上。结论 北京地区TTV分离株和日本株属同一基因型。