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猪链球菌脉冲场凝胶电泳分析方法的建立

         

摘要

目的建立一种可共享的猪链球菌脉冲场凝胶电泳分析(PFGE)方法。方法利用PulseNet技术优化猪链球菌PFGE分子分型方法,提出新的分析方案,包括胶块的制备、内切酶的选择、电泳条件等。利用DNAStar的Mapdraw软件对猪链球菌基因组序列进行分析,发现在242种内切酶中,SwaⅠ、SmaⅠ、ApaⅠ种酶比较适合。结果通过对34个血清型共100株菌的分析,发现使用SwaⅠ可获得59种带型,使用SmaⅠ可获得53种带型,使用ApaⅠ可获得43种带型。其中以SwaⅠ的分辨率最好。结论提出猪链球菌的SwaⅠPFGE分析方法,并对条件进行优化,较原方法所需时间短、图像清晰,更具有可重复性,基本具备推广的条件。

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