基于生物信息数据研究肿瘤突变负荷在结肠癌中的临床意义

摘要

目的 研究肿瘤突变负荷(TMB)在结肠癌患者中的临床意义.方法 通过癌症基因组图谱获取结肠癌的体细胞突变数据、基因表达数据及相关临床数据,计算结肠癌患者的TMB值并分析TMB与总生存率的关系,对高、低TMB组基因表达数据进行基因富集分析,应用Wilcoxon秩和检验分析高TMB组与低TMB组浸润性免疫细胞占比及免疫检查点分子表达差异.结果 高TMB组患者总生存率明显低于低TMB组(χ2=5.351,P=0.021).基因富集分析提示,高TMB组在许多免疫相关通路明显富集.高TMB组CD8+T细胞、CD4+记忆性T细胞、自然杀伤细胞及M1巨噬细胞水平高于低TMB组(Z/P=-2.151/0.032、-1.988/0.047、-3.090/0.002、-2.783/0.005),调节性T细胞、MO巨噬细胞浸润程度低于低TMB组(Z/P=2.494/0.012、2.114/0.035).高TMB组免疫检查点分子表达显著高于低TMB组(P<0.01).结论 高TMB的结肠癌患者预后较差,并且TMB明显影响浸润性免疫细胞及免疫检查点分子的表达.