乳腺原发癌与淋巴结转移癌基因表达谱的比较研究

摘要

目的:通过乳腺原发癌与淋巴结转移癌基因表达谱的比较研究,筛选乳腺癌转移相关基因,探讨淋巴结转移阳性乳腺癌患者分子分型的临床意义.方法:采用cRNA扩增方法分别将乳腺原发癌和配对的淋巴结转移癌标记Cy3和Cy5的荧光探针,与点有21 329个人功能基因的Oligo芯片进行配对杂交,筛选30例病例中至少16对样本(50%以上)有2.0倍以上相同差异表达趋势的基因;采用Cluster3.0对样本及病例进行非监督聚类分析.结果:共筛选得到95个差异表达基因,其中41个在转移癌中表达上调,54个下调;分别与细胞粘附和运动能力、细胞外基质、蛋白水解酶、信号传导与转录调节、细胞生长与凋亡相关.基于全基因表达谱对样本聚类将83.3%(25/30)病例的原发癌与其配对的淋巴结转移癌聚类在一起;基于差异表达基因对病例的聚类分析将30例患者分为2组,其中A组与B组比较,A组多为肿瘤体积T3～4(P＜0.05)、ER阴性(P＜0.05)、组织学Ⅲ级(P=0.073)和3年内发生远处转移(P=0.085)的预后较差的病例.结论:以同一病例乳腺原发癌与其淋巴结转移癌进行基因表达谱的比较分析,筛选得到的在多病例中有共同差异表达趋势的基因,涉及了与转移相关的重要生物学过程;同一病例的原发癌与转移癌聚类在一起,证实淋巴结转移癌是其原发癌高转移能力细胞的亚克隆,因而具有相近的基因表达谱,其中的差异基因即包含了涉及转移表型的基因改变,基于原发癌差异基因的表达谱可以将淋巴结转移阳性乳腺癌病例进行分子分组并能预测预后.