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不同新型冠状病毒核酸检测试剂的临床性能评价

         

摘要

目的 评价同一厂家新型冠状病毒(2019?nCoV)核酸检测扩增时间长的试剂(试剂A)与扩增时间短的试剂(试剂B)的临床性能,分析试剂更换的可行性.方法 用2019?nCoV阴性混合样本将商品化2019?nCoV RNA液体室内质控品(以ORF1ab浓度赋值17300 copies/mL)梯度稀释成1730、865、567.7、432.5、216.3、108.2 copies/mL 6个浓度,在连续3 d内每个浓度每天做7~8个复孔,共计23个复孔,进行磁珠法提取核酸和实时荧光RT?PCR扩增,以评价试剂A和B的分析灵敏度.用试剂A和B分别检测来自华中科技大学同济医学院附属协和医院2020年2月9日发热门诊的130例患者咽拭子样本核酸,进行临床检测性能评价,并将其中5例2019?nCoV强阳性核酸连续10倍梯度稀释作2种试剂的相对灵敏度评价.结果 试剂A和B检测1730、865、567.7、432.5、216.3和108.2 copies/mL的质控品稀释液中ORF1ab基因的阳性率分别为100%和100%、95.65%和82.61%、95.65%和78.26%、91.30%和78.26%、65.22%和43.48%、34.78%和17.39%;试剂A和B的最低检测限分别为615.9(95%CI:446.0~1098.5)copies/mL和1249.1(95%CI:863.4~2378.8)copies/mL.5例2019?nCoV强阳性的临床样本核酸在1:10和1:100稀释时,试剂A和B对ORF1ab和N基因检出率均为100%;而1:1000稀释时,对于ORF1ab和N基因,试剂A的检出率均为100%,试剂B的检出率分别为73.3%和80.0%.130例咽拭子样本中,试剂A 2019?nCoV RNA检测阳性率为43.85%,试剂B为33.08%,差异有统计学意义(P<0.05);2种试剂的检测结果一致性较好(kappa=0.7753),阳性符合率为75.44%(43/57),阴性符合率为100%(73/73),阳性预测值为100%(43/43),阴性预测值为83.91%(73/87),总符合率为89.23%(116/130).结论 2种2019?nCoV核酸检测试剂的临床性能之间存在差异.为保证2019?nCoV核酸的检测质量,不宜将该厂家扩增时间长的试剂更换为扩增时间短的试剂.

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