食管鳞状细胞癌患者血清全基因组microRNA测序和分析

摘要

目的 通过测序、分析食管鳞状细胞癌(ESCC)患者血清全基因组微小核糖核酸(miRNA)表达谱,筛选出表达上调的miRNA,探讨其作为ESCC分子标志物的可能性.方法 收集未经治疗的199例ESCC患者血清,同时以107例年龄、性别匹配的健康人血清作对照.用Solexa测序技术对血清miRNA进行测序和表达量测定,用实时荧光定量PCR技术对表达上调的miR-223验证,并与血清CEA含量比较.结果 Solexa测序结果显示,ESCC患者和健康人混合血清小分子RNA中miRNA含量所占比例分别是75.46％和81.44％,22种miRNA在患者血清中表达量是健康人对照的2倍以上;PCR分析证实,miR-223在患者血清中的浓度[M( P25,P75)]显著高于健康人对照[893.8(684.8,1 200.7) fmol/L vs 445.6(347.7,664.0) fmol/L,t=10.03,P ＜0.01]；用于ESCC诊断的miR-223 ROC曲线下面积(AUCROC)为0.84(95％CI,0.79 ～0.89),明显大于CEA的0.55(95％CI,0.48 ～0.62),P ＜0.01；当cut off值为710.2 fmol/L时,miR-223诊断ESCC的敏感性和特异性分别为70％、80％;ESCC患者年龄、性别、病理类型、TNM分期、吸烟史、饮酒史与血清miR-223水平无明显相关性(P＞0.05).结论 ESCC患者血清miRNA表达谱与健康人存在差异,miR-223在患者血清中浓度显著升高,是ESCC潜在的分子标志物.