联合应用激光捕获显微切割与基因芯片技术筛选肝细胞癌差异表达基因

摘要

目的 联合应用激光捕获显微切割与基因芯片技术构建纯化肝细胞癌(HCC)组织和正常肝组织基因表达谱,筛选HCC发病相关基因.方法 4例HCC标本先行激光捕获显微切割,分别获取纯化肝癌细胞和正常肝细胞各4对样本.提取微量RNA,经线性扩增后再与全基因组基因芯片杂交,筛选差异表达基因.结果 4对样本间纯化肝癌细胞与正常肝细胞共同差异表达的基因有1361条,上调基因607条,下调基因754条.前10位显著上调和下调的差异表达基因(共20条)中,5条为HCC已知差异表达基因(信号比值为23.2529、27.372 9、0.014 8、0.019 7、0.019 8);11条表达变化与其他肿瘤研究报道一致(信号比值为32.694 9、28.480 9、23.703 0、21.342 3、19.109 3、17.291 9、0.009 8、0.012 5、0.015 8、0.016 1、0.016 5);4条为在HCC和(或)其他肿瘤中均无报道过的差异表达基因(信号比值为24.676 1、22.072 2、0.009 7、0.019 1).结论 联合应用激光捕获显微切割与基因芯片技术,可准确、高效地筛选出HCC差异表达基因.