基于Hi-c数据的酵母染色体三维结构重构

摘要

通过染色体交互频率数据(Hi-c)来预测染色体三维空间结构是近年表观遗传研究热点.研究表明染色体三维空间结构在生物基因表达、调控等方面起到重要作用,对其进行三维重构是研究细胞代谢过程的基本途径.针对酵母Hi-c数据在不同染色体所呈现出的统计特征,拟合出每条染色体交互频率数据分布的数学模型,然后利用梯度上升迭代算法预测并重构其三维结构,并给出模型评估指标.实验结果表明,模型具有较高可重复性和预测精确度.