基于模糊理论预测CpG岛新方法

摘要

启动子区域的CpG岛的异常甲基化是识别癌症的重要标志之一.目前已经建立的一些CpG岛的预测思想和方法都有自身的缺点,基于模糊理论的预测思想从贴进度的角度来判定CpG岛,能更容易地找到被以往方法所忽略的具有更多生物学意义的CpG岛.本研究通过构建属于CpG岛集合的隶属函数,计算候选序列的隶属度,找出所有的可接受隶属程度的CpG岛.将该方法应用于UCSC数据库中的一段序列(hg18_chr1_31618510_31623510_-1000)进行预测,发现提高了预测的精确度.可见应用模糊理论预测CpG岛具有一定的可行性,利用选取不同的截集,可以得到更为精确的CpG岛.