细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析

摘要

本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE 2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE 2s基因家族进行T-A克隆、生物信息学分析以及采用qRT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Protoscolex,PSCs)和28日龄童虫中的转录水平。结果成功克隆并测序19个EgE 2s基因,更正了两个原序列有误的EgE 2s,登录号分别为EgE 2L3(登录号:MZ277618);EgE 2J1(登录号:MZ277619)。三级结构和保守基序预测结果表明EgE 2s高度保守。qRT-PCR结果显示,EgE 2s的转录水平在PSCs和28日龄童虫中存在差异,其中EgE 2A(P<0.001)、EgE 2J1(P<0.01)在PSCs阶段高表达。B细胞抗原表位预测表明Eg E2N的139-157区域位于Eg E2s保守基序外。同时,T细胞抗原表位预测表明Eg E2N与人和犬MHCⅠ类分子各有两个强结合位点,且有一个共同的抗原表位位点104-113。综上,EgE 2A和EgE 2J1可能在PSCs的生长发育中起重要作用。Eg E2N的139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列。