椰子油对育成猪肝脏转录组高通量测序的影响

摘要

试验设计了椰子油组和对照组2个处理.采集育成猪肝脏组织,进行转录组高通量测序,找出2种处理间的差异表达基因及差异代谢通路.利用Illumina HiSeqTM2 500高通量RNA-seq测序技术测序,使用TopHat2软件将测序得到的reads序列与猪参考基因组(Sscrofa10.2)序列比对,找出差异表达基因,并在Nr、GO和KEGG数据库中进行功能注释、富集分析和聚类分析.结果表明:椰子油组和对照组肝脏中差异表达基因共有487个,与对照组相比,椰子油组表达上调的基因有222个,下调的基因有265个.在差异表达上/下调前15位基因中,有多个基因是参考基因组中没有的新基因和功能未知基因.GO功能分类注释到细胞组成、分子功能和生物学过程数据库中的差异表达基因数分别有398、368个和398个;注释到KEGG通路中差异表达基因数188个.