棕熊蛔虫ITS rDNA的PCR扩增与序列分析

摘要

目的 以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园棕熊分离的蛔虫种类.方法 应用PCR方法以保守引物NC5和NC2扩增蛔虫样本的ITS及5.8S rDNA序列,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-T Esay载体,用菌落PCR及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落进行测序,并与Gen-BankTM公布的人蛔虫(Ascaris lumbricoides)、猪蛔虫(Ascaris suum)、浣熊贝利斯蛔虫(Baylisascaris procyonis)及狮弓蛔虫(Toxascaris leonina)ITS序列比较.结果 从棕熊分离的2个蛔虫样本的ITS及5.8S rDNA总长为859～861bp,种内相似性为99.7%,与GenBankTM公布的人蛔虫、猪蛔虫、浣熊贝利斯蛔虫及狮弓蛔虫的相似性分别为84.6%、84.5%、89.3%及72.3%,序列差异明显.结论 棕熊蛔虫不同于上述种类蛔虫,可能为Baylisacaris transfuga.