基于Java的基因本体工具包

张国庆; 骆清铭; 鲁强; 李亦学

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基于Java的基因本体工具包

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针对基因本体的需求,利用Java技术,以模块化设计的方式实现了基因本体工具包GO4J.该系统包括4个模块.解析器模块把GO载入到内存中;图数据结构模块记录了所有的GO条目之间的关系;语义相似性模块评估两个GO条目之间的相似程度;可视化模块直观展示GO条目和根节点之间的路径.GO4J把这4个模块整合到本体浏览器中,可以结合GO注释的生物数据来对具体的生物数据进行分析.

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来源
《高技术通讯》|2006年第7期|735-739|共5页
作者
张国庆; 骆清铭; 鲁强; 李亦学;
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作者单位

华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室,武汉,430074;

华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室,武汉,430074;

华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室,武汉,430074;

上海市生物信息技术中心,上海,200235;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物工程学（生物技术）;
关键词
基因本体; 解析器; 图模型; 语义相似性;

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