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基于网络药理学和实时荧光定量聚合酶链式反应法探讨鬼臼毒素对胃癌的作用机制

         

摘要

目的利用网络药理学和实时荧光定量聚合酶链式反应(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)法研究鬼臼毒素对胃癌的作用机制。方法利用TCMSP、Pubchem、Swiss Target Prediction、Similarity ensemble approach、Pharmapper数据库预测鬼臼毒素作用于胃癌的潜在靶标,通过蛋白互作网络和富集分析法找到关键节点和作用的主要通路,并采用qRT-PCR实验验证潜在靶基因。结果通过查询多个数据库筛选获得15个胃癌特征基因(可能为鬼臼毒素的潜在靶标)。PPI网络图谱进一步显示,15个基因所对应的蛋白是鬼臼毒素作用于胃癌的关键靶标。通过GO富集分析和KEGG通路富集分析确定PI3K/AKT通路为主要作用通路。通过qRT-PCR验证发现,鬼臼毒素可以抑制与PI3K/AKT信号通路相关基因(CCND1、TP53、MET、RELA、EGFR、BCL2L1、IGF1R)的表达。结论鬼臼毒素可能通过PI3K/AKT信号通路发挥抗胃癌细胞生长的作用。

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