广西农业科学院发布迄今最连续的茄子基因组序列

摘要

2019年10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所王益奎研究员领衔的研究团队,于BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该基因组采用了当下最先进的基因组测序与组装技术,堪称茄科植物中最连续的基因组,标志着茄子基因组研究迈入了高清时代。茄子(Solanum melongena L.)是茄科最重要的作物之一,在茄属植物中产量和经济价值居第三位。本次公布的茄子参考基因组,Contig N50达到了5.3 Mb,Scaffold N50更是达到了93.9 Mb,序列总长度1155.8 Mb,是迄今最连续的茄子基因组。研究团队采用PacBio测序技术,结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法,成功获得了染色体级别的连续基因组,将对茄子的基因组学研究产生深远的影响。