一种构建超长连续DNA序列的基因组组装方法

摘要

本发明公开了一种构建超长连续DNA序列的基因组组装方法，S1，找出每对已知DNA序列之间的重叠区域；S2，从任一个锚定序列片段的一个自由末端开始，用跟其有重叠的Read序列对其进行延伸，循环多次，直至遇到能够比对到另一不同的锚定序列片段末端的Read序列，获得一条或多条通路序列；S3，从所有的通路序列中选择最多一条作为连接起始锚定序列片段末端到另一个终点锚定序列片段末端的有效连接序列；S4，利用该有效连接序列连接起始和相应的终点锚定序列片段；连接后作为新的锚定序列片段或记录剩余的锚定序列片段的自由末端，转到S2；重复步骤S2‑S4，最终形成超长连续的DNA序列。本发明更有利于复原整条染色体及整个基因组的序列。