瓜类蚜传黄化病毒在南疆的检测及系统进化

摘要

2019年从南疆7个县/市采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)侵染典型特征的47份甜瓜叶片样品,通过RT-PCR进行CABYV的检测,从县/市各选出1份代表性样本,进行特异性片段的克隆、测序,以及核苷酸多样性、蛋白序列和系统发育分析.结果显示,28份样本呈现CABYV阳性,检出率为59.57％,巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县、洛浦县的检出率分别为80.00％、28.57％、83.33％、60.00％、37.50％、71.42％、66.67％.克隆测序获得了707 bp的核酸序列,核苷酸多样性值在0.012～0.018之间,所有序列均具有2个开放阅读框(ORF).ORF1编码199个氨基酸的外壳蛋白(CP),各县/市的序列相似性为99.07％.ORF2编码191个氨基酸的运动蛋白(MP),各县/市的序列相似性为98.80％.基于CP和MP序列构建的系统发育树表明,各县/市得到的所有CP和MP均聚在亚洲分支.CABYV在南疆甜瓜主产区普遍发生,且不同区域核苷酸变异很低,这些地区的CABYV与中国及日本分离物的亲缘关系较近,而与欧洲及中国台湾分离物的亲缘关系较远.