基于GSEA分析FoxM1表达变化对人肝内胆管细胞癌增殖及侵袭相关信号通路的影响

摘要

目的通过比较分析FoxM1表达高低对肝内胆管细胞癌(ICC)中增殖及侵袭相关细胞信号通路的影响,进而部分揭示其发生发展分子机制。方法从TCGA数据库下载36例ICC患者的mRNA数据,按照总体叉头盒蛋白M1(FoxM1)表达值中位数将其分为FoxM1高表达组、FoxM1低表达组,使用基因集富集分析(GSEA)软件进行生物信息学分析寻找FoxM1高低表达组之间可能存在的差异表达基因及影响的相关信号通路。采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)比较ICC细胞系中FoxM1及P53 mRNA的表达关系。结果GSEA分析表明,ICC中FoxM1高表达组中常见基因信号通路如P53、MYC信号通路表达差异均有统计学意义,而FoxM1低表达组中FOXO等信号通路表达差异有统计学意义(均FDR-q值<0.250)。RT-PCR结果显示,慢病毒转染后上调FoxM1表达的HCCC-9810-FoxM1细胞组中P53 mRNA表达较对照组升高,而下调FoxM1表达的SSP-25-shFoxM1细胞组中P53 mRNA水平较对照组则下降,差异均有统计学意义(P<0.0001)。结论FoxM1可能在ICC发生发展等不同演进阶段产生广泛作用。FoxM1表达可能与P53相关,ICC中FoxM1可能影响P53信号通路。