基于iTRAQ技术的肝癌细胞蛋白质组学研究

摘要

目的 利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术筛选稳定表达乙型肝炎病毒(HBV)的HepG2.2.15细胞与其亲本HepG2细胞差异表达的蛋白.方法 使用iTRAQ技术对HepG2.2.15细胞和HepG2细胞中的差异蛋白进行分析,并借助生物信息学对差异蛋白进行功能聚类和信号通路分析.以两组间细胞差异倍数(FC)≥1.2及P<0.05为标准筛选差异蛋白.应用基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)等分析软件对差异蛋白进行生物信息学分析.结果 本研究共筛选出856个差异表达蛋白,其中上调差异蛋白497个,下调差异蛋白359个;GO分析发现差异蛋白参与生物过程主要包括免疫过程和信号转导过程;大部分差异蛋白细胞组分分布在细胞质和细胞外;差异蛋白的分子功能主要集中在受体结合和金属离子结合.KEGG分析发现差异蛋白主要参与众多细胞生物学功能调控,包括药物代谢、化学致癌、细胞色素P450代谢异物以及丝裂原活化蛋白激酶信号通路等.结论 基于iTRAQ技术筛选出的差异蛋白之前尚未与HBV复制相关联,这些蛋白可为进一步探究HBV复制提供线索和实验基础.