基于生物信息学挖掘糖尿病心肌病表达谱芯片

摘要

cqvip:目的基于生物信息学技术挖掘糖尿病心肌病(DC)相关差异表达基因及其功能。方法应用生物信息学方法分析基因表达谱数据集GSE4547。结果挖掘原始芯片数据,筛选到79个差异表达基因。基于基因本体论功能注释和相关通路分析,以及通过构建差异共表达基因蛋白质互作网络及模块分析后,最终获得Hk2、Col1a2、Col1a1、Col3a1、Slc2a1、Cpt1a、Slc2a4、Cd36、Ucp3、Pdk4 10个关键基因为链脲佐菌素诱导DC的关键基因。结论最终获得的10个关键基因可能成为未来治疗糖尿病心肌病的潜在治疗靶点,为今后探究与DC相关基因和信号通路的功能变化提供新的视角和导向。