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缺氧处理后鼠脑星形胶质细胞基因表达谱的初步分析

         

摘要

目的:本实验利用基因芯片技术研究缺氧处理后鼠脑星形胶质细胞基因表达谱的变化,以深入认识星形胶质细胞在缺氧处理后基因表达变化规律,为进一步全面认识神经胶质细胞在缺血情况下基因变化规律以及神经胶质细胞与神经元在损伤条件下相互依存关系提供实验依据和理论基础.方法:用TRIzol试剂经过多个步骤提取各组制备好的星形胶质细胞样本总RNA;利用基因芯片技术获取缺氧处理后鼠脑星形胶质细胞的基因表达谱;利用Gene Ontology Consortium分析系统、Gene Cards数据库和Pubmed检索系统对基因表达谱进行初步分析.结果:基因表达谱:在基因芯片上测定了4096个点,共有差异表达基因153个,其中,已知差异表达基因45个,未知差异表达基因108个(EST片段);己知差异表达基因:在45个已知差异表达基因中,表达下调的基因有22个,表达上调的基因有23个,未见报道的与缺氧处理相关基因28个,已报道的有17个;已知差异表达基因功能聚类:共8类.结论:本实验获得鼠脑星形胶质细胞缺氧处理后的基因表达谱;首次发现28个与缺氧相关的未见报道基因;初步明确已知差异表达基因在缺氧处理后的基本变化规律.

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