基于高通量测序技术巴彦淖尔市酸粥中细菌多样性分析

摘要

采用Illumina MiSeq高通量测序技术对采集自内蒙古自治区巴彦淖尔市的10份酸粥样品中的细菌多样性进行解析,同时基于细菌属水平对其进行围绕中心点的划分(PAM),并基于PICRUSt和BugBase软件对细菌的基因功能及表型进行预测.结果 表明,所有酸粥样品中的细菌隶属于9个细菌门的55个属,样品间细菌多样性和丰度存在明显差异,但优势细菌门均为硬壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),优势细菌属均为乳杆菌属(Lactobacillus)和醋杆菌属(Acetobacter).所有酸粥样品可分为两个聚类,聚类I以醋杆菌属(Acetobacter)为主,聚类Ⅱ以乳杆菌属(Lactobacillus)为主;两个聚类中细菌对于碳水化合物的利用和细菌的生长繁殖等存在显著差异(P＜0.05),隶属于聚类Ⅰ的酸粥样品中,其细菌的代谢和繁殖更加迅速.