鸡腺病毒12个血清型代表毒株Penton蛋白基因分析

摘要

为了解鸡腺病毒(fowl adenovirus,FAdV) Penton基因的遗传进化规律,试验根据GenBank中已公布的各基因型序列设计特异性引物,通过PCR技术分别扩增12个血清型毒株的Penton基因,连接至pEASY-BluntSimple Cloning Vector上进行序列测定,并将12个血清型毒株Penton蛋白的核苷酸序列与NCBI上已公布的标准毒株的核苷酸序列使用ClustalW法进行分析比对,绘制遗传进化树.结果 显示,12种血清型Penton蛋白核苷酸序列与各血清型标准毒株同源性均在99.2％以上,其中FAdV-1、FAdV-2、FAdV-3、FAdV-4、FAdV-6、FAdV-7、FAdV-8a、FAdV-8b、FAdV-10、FAdV-11与对应标准株同源性高达100％,这进一步证实了实验室保存毒株与世界相应标准毒株的一致性.Penton蛋白虽然保守性较高,但不同种之间仍存在明显差异.FAdV-A1与其他种毒株同源性为70.6％～73.3％;FAdV-B5与其他种毒株同源性为70.6％～77.9％;FAdV-C同种不同血清型之间核苷酸同源性为99.6％,FAdV-C4与其他种之间同源性71.2％～73.4％;FAdV-D同种不同血清型之间核苷酸同源性为95.6％～98.7％,与其他种之间最高为85.3％;FAdV-E同种不同血清型之间核苷酸同源性为98.2％～99.4％,不同种间最高为85.3％.即相同种毒株之间差异较小,不同种毒株之间差异较大.依据Penton蛋白的核苷酸序列同样可以将FAdV分为A、B、C、D、E5个种.本研究通过成功克隆FAdV 12种血清型Penton基因,并进行遗传进化分析,为今后对FAdV诊断、监测及毒株鉴定提供了参考.