内蒙古鼠疫自然疫源地鼠疫菌耐药相关基因检测及生物信息学分析

摘要

【目的】试验旨在对内蒙古鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis,鼠疫菌)抗生素及消毒剂耐药基因进行检测及生物信息学分析,以期为该地区的鼠疫防控提供科学依据。【方法】利用PCR对60株内蒙古鼠疫自然疫源地鼠疫菌的DNA进行耐链霉素耐药基因(StrA、StrB)、β-内酰胺类耐药基因(Tem、Ctx-m)、磺胺类耐药基因(Sul1、Sul2)和季铵盐类消毒剂耐药基因(QacEdelta)检测,并预测StrA、Sul1和QacEdelta蛋白的结构功能及抗原表位。【结果】PCR扩增结果显示,阴性对照和阳性对照均成立,60株鼠疫菌扩增结果均为阴性。从内蒙古鼠疫自然疫源地分离的鼠疫菌株中未发现有耐链霉素、磺胺类、β-内酰胺类抗菌药物及耐消毒剂等相关基因的菌株。生物信息学分析表明,StrA、Sul1和QacEdelta蛋白均为不含有跨膜区的疏水性外膜蛋白,且均属于分泌蛋白。3种蛋白的二级结构均以α-螺旋为主,占比分别为37.83%、45.88%和46.09%。抗原表位预测显示,3种蛋白中B细胞表位分别为9、8和3个;T细胞表位分别为9、16和14个。【结论】内蒙古鼠疫自然疫源地分离的60株鼠疫菌均未检测到耐药及耐消毒剂相关基因。StrA、Sul1和QacEdelta蛋白含有较多的B、T细胞抗原表位,具有较好的抗原性。本试验结果为指导该疫源地的鼠疫防控工作中合理使用抗菌药物和消毒剂提供参考依据。