一株野鸟源H3N8亚型流感病毒分离株的全基因组序列分析

摘要

本研究对2014年从新疆额敏县分离到的一株野鸟源H3N8亚型流感病毒A/wild bird/Xinjiang/S3525/2014(H3N8)进行了全基因序列和进化分析.序列分析显示,HA裂解位点序列为339PEKQTR-GLFG348,为典型的低致病性禽流感病毒特征,NA基因具有6个潜在的糖基化位点,与病毒株A/mallard/Czech Republic/14333-1K/2011 (H3N8)核苷酸高度同源(97.7％).该毒株的内部基因来源较复杂,其PB1、NP基因分别与A/ruddyshell duck/Mongolia/921 C2/2009 (H7N1)和A/wild duck/Korea/MHC39-26/2011 (H7N9)的同源性最高,其余内部基因与H2、H3、H6、H7等亚型禽流感病毒分离株同源性最高,呈现明显的异源性.除PB2基因外,其余基因片段均来源于野鸟源禽流感病毒.