分子对接法和光谱法研究BRCA1846-871及其五突变肽与RAD51181-200相互作用

摘要

影响RAD51蛋白的修复功能,可有效改善肿瘤细胞对化疗药物的耐受性.利用计算机模拟BRCA1846-871关键肽段五个活性位点的突变,通过分子对接法筛选出与RAD51181-200相互作用较强的9条五突变肽.采用固相合成法合成目标多肽,利用反相高效液相色谱(RP-HPLC)技术分离、纯化得到纯度大于93％的纯品肽,电喷雾电离质谱(ESI-MS)技术进行表征.通过荧光光谱法和圆二色光谱法(CD)研究BRCA1846-871及其五突变肽与RAD51181-200的相互作用.荧光谱图显示,除P6外,其余配体均与受体RAD51181-200发生静态猝灭.在室温下,P1(4.17×104 L·mol-1)、P4(7.61×104 L·mol-1)和P5(1.19×104 L·mol-1)与受体RAD51181-200结合较强.圆二色光谱图显示,P1、P4和P5使受体RAD51181-200的α-螺旋结构含量降低非常明显,从60.5％分别下降为35.7％、36.3％和36.4％,BRCA1846-871、P3、P6和P9对受体α-螺旋结构含量影响较小,从60.5％分别下降为56.3％、55.6％、55.6％和54.6％,而P2、P7和P8对受体α-螺旋结构含量几乎不产生影响.综合光谱分析结果可知,配体P4与受体RAD51181-200的相互作用最强.