酵母AHAS酶与磺酰脲类抑制剂作用模型的分子对接研究

摘要

基于酵母乙酰羟酸合成酶(AHAS)与磺酰脲类抑制剂复合物的晶体结构,用分子对接方法对AHAS与5个磺酰脲类抑制剂相互作用的方式进行了系统的分子对接研究.晶体复合物对接和假复合物对接两种模式对接的结果基本相同,并与实验结果吻合.在进一步的对接中逐级考虑了辅酶FAD和TPP的影响,结果表明,辅酶FAD和TPP的加入,对AHAS酶与磺酰脲类抑制剂的结合顺序基本没有影响.其中FAD的加入使AHAS与抑制剂的结合更加稳定,这主要是由于抑制剂的R2取代基与FAD中的平面基团Flavin环间存在的范德华相互作用所致;抑制剂与TPP间存在的静电相互作用可能是加速TPP降解的原因.