甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析

摘要

根据筛选文库时获得的EST序列信息,利用RACE技术分离了一个甘蔗ATP酶C亚基基因,命名为ShVHA-C.该基因cDNA全长1 312 bp,舍有1 056 bp的完整阅读框架,编码351个氨基酸.序列比对及结构预测分析表明,ShVHA-C编码的氨基酸序列与水稻、小麦、苜蓿、绿豆和蓖麻中相应基因氨基酸序列的一致性分别达到94.10%、93.22%、91.15%、91.15%和91.74%,与水稻一致性最高.在整个二级结构中,含有233个α-螺旋(alpha helix),占66.38%;舍有5个延伸链(extended strand),占1.42%;含有113个无规则卷曲(random coil),占32.19%.此蛋白不具有导肽.整个多肤链表现为亲水性,没有明显的疏水区域,初步认为甘蔗ShVHA-C编码蛋白是亲水性蛋白.