乙肝相关性肝癌中新基因CHCHD2的生物信息学分析

摘要

应用基因芯片技术获取以稳定转染HBx基因的肝癌细胞HepG2(HepG2-x)及非转染的肝癌细胞HepG2的差异表达的基因,利用生物信息学方法对新基因CHCHD2进行初步分析表明,该蛋白开放性读码框长456 bp,编码151个氨基酸残基,相对分子量为15.55 kD,等电点9.43,是主要定位于线粒体中的亲水性蛋白,二级结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主要构件.同源性比较分析结果表明,其碱基序列与已经报道的其他17个物种相似性为64％-99％,且符合种属之间的进化关系.