麦洼牦牛HOXA6基因编码区的克隆、组织表达特征及生物信息学分析

摘要

利用分子克隆技术成功获得麦洼牦牛HOXA6基因编码区序列,并结合内参基因通过实时相对定量PCR法检测HOXA6基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布.采用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行基本理化性质、疏水性、二级结构等分析,并构建原核重组表达系统.结果表明,该基因包含一个大小为702 bp的开放阅读框,编码233个氨基酸;所编码的蛋白属于亲水性蛋白,二级结构主要由无规则卷曲和α螺旋为主.HOXA6基因的编码产物氨基酸进化树表明,HOXA6基因进化极其保守,牦牛HOXA6与牛、绵羊、马等物种氨基酸遗传距离较近.对其编码区序列比对显示,该序列具有高度保守性,与其他物种同源性较高.