广西狂犬病病毒与狂犬病疫苗株N基因序列分析

摘要

目的 了解广西狂犬病病毒(RABV)街毒株与疫苗株N基因序列的差异,为疫苗使用提供理论依据.方法 采用直接免疫荧光法(DFA)和巢式RT-PCR法检测,测定病毒N基因序列全长,同时根据N基因序列同源性及系统进化树比较,分析广西近年流行的RABV与国内外10株疫苗代表株N基因序列之间的差异.结果 DFA法阳性率为8.84％ (350/3 961),RT-PCR法检测阳性率1.29％(51/3 961),获得N基因全序15份;15份N基因核苷酸与氨基酸序列同源性为89.40％～100％和98.40％～99.80％;广西15份(RABV)与国内外10株疫苗代表株N基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为85.70％～99.70％和94.90％ ～99.80％,与中国CTN疫苗株N基因的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为89.60％ ～99.70％和98.40％～99.80％.N基因系统发生树分为两大分支,15份(RABV)与中国人用CTN株构成第一分支,其余的疫苗毒株构成第二分支.结论 广西犬间流行的RABV与中国人用CTN疫苗株N基因序列同源性最高、亲缘关系最近,在广西地区使用CTN疫苗株效果可能较好.