采用未培养技术对荷斯坦奶牛瘤胃细菌多样性进行初步分析

摘要

采用未培养(Culture independent)技术直接从荷斯坦奶牛瘤胃液中提取瘤胃细菌微生物混合DNA(也叫元基因组DNA),利用细菌16S rDNA通用引物27F与1492R,扩增瘤胃混合微生物的16S rDNA,根据16S rDNA序列对瘤胃细菌多样性进行初步分析.通过16S rDNA序列同源性分析,发现有多于一半以上的序列与可培养的菌株的同源性小于90%,属于不可培养的菌株.选用45条测得序列与已知序列构建系统发育树,分析结果表明,它们分属于两大类LGCGPB(the low G+C Gram positive bacteria) 和CFB (Cytophaga-Flexibacter- Bacteroides group), 剩下的克隆尚难确定其分类地位,可能是代表新属和种的序列,这些序列已向GenBank提交并得到序列号(AY986777-AY986791).