基于线粒体DNA控制区的石鸡华北亚种的种群历史动态研究

摘要

隶属于鸟纲鸡形目雉科的石鸡是一个多型种,在我国已有7个亚种被报道,其中石鸡华北亚种是我国的特有鸟.用石鸡华北亚种(Alectoris chukar pubescens)12个地理种群112个样本的线粒体DNA控制区(mtDNA CR) 1154 bp序列的信息研究了石鸡华北亚种的种群历史动态.112个样本中共发现28个变异位点,定义了29种单倍型,其中12个地理种群的50个样本共享单倍型H1,8个地理种群的16个样本共享单倍型H4.地理种群间存在较大的基因流,且种群间没有由于地理距离产生隔离的证据.负的Tajima(D=-1.336,P＜0.05)和Fu(Fs=-1.720,P＜0.05)统计检验值及错配分布的单峰模式都支持石鸡华北亚种经历了种群扩张.石鸡华北亚种大部分种群的错配分布与种群过去的扩张相一致,扩张发生在晚更新世中期的第五寒冷期(0.027-0.06 Ma).推测其扩张的原因可能为:1)更新世期间我国北方地区没有发生大规模的冰川,2)青藏高原的隆升使我国北方干旱化和荒漠化加剧利于石鸡种群的扩散.武都(WD)位于东洋界,而石鸡是典型的古北界的鸟种,表明WD种群可能是石鸡在东洋界的一个建群种,因此需要给予充分的关注.